烏魚子以台灣本地所產的較佳，香氣較濃，不過價錢也較烏魚子貴；相比之下，外來的「巴西烏魚子」香氣反而不如土產烏魚子，其選購原則為：色澤呈暗紅色、聞起來有香氣、吃起來會黏牙者為佳。 烏魚子容易碎掉，所以買回後不可接觸日光，應先在通風處風干2至3天，再放入冷凍庫中，如此約可保存半年；烏魚子不能生食，一定要經過烹調才能食用，但不可油炸，因為會碎掉，所以正確的處理方式是，先抹上米酒，放入已預熱250度的烤箱之中烘烤，或是在鍋中用大火快烤。但兩種方式都得等到烏魚子稍微烤焦起泡後，料理手續才算完成。另外，也可採水煮方式，可用筷子將烏魚子夾入滾水中汆燙，約10到15秒翻面，再燙10到15秒即可撈起，然後切片，搭配生蒜或生烏魚子白蘿蔔切片，沾醬油食用，十分美味。
