水泵過濾器系統的動力裝置，分沉水式和離水式兩種，以無摩擦電磁脫水機動轉子驅動，理論上可永久運轉，沉水式為全密封結構，靠水體降溫，離水後轉子線圈會因高溫燒毀上部過濾器架於魚缸上部的過濾槽（盒），由沉水式水泵或離水式水泵驅動供水，靠瀉流口，使水流回魚缸，維護間格時間較短維護較方便，但不推薦用於加注CO2的水草缸沉水式過濾器在沉水式水泵下方進水口處直接裝上置有濾棉或深化棉的濾盒（桶）維護間格時間較短，親洗較不便，價格便易外置式過濾器一般為桶狀結構，水泵一般直接造於桶蓋中，經由管道從魚缸中抽水，在桶內進行物理及生化過濾後，再經由出水管流回魚缸，濾體較大，維護間格時間較長，清洗較不便，價格貴。
底部式過濾器是利用底砂砂層作為大體積的濾材（滲流濾層），通過鋪設在砂層下的進水管道，經由沉水水泵抽，達到物理過濾及生化過濾的目地（原理類似於沉水式過濾器）因濾體（砂）較大，所以維護間格時間較長（半年以上），但維護極為不便（須翻缸）。
溢流式過濾器滴流過濾方式，完全的生物過濾過濾設備，無物理過濾能力。須DIY，在水族箱中隔出一塊空間，以生化球或陶瓷環為濾材，用溢出的水以淋灌方式進入濾材間隔，（一般還需要在濾材間隔底部接上氣馬達的出氣砂頭打氣）進行好氧細菌的生物過濾，再由濾材間隔底部的水泵通過管道將溢下的水打回入魚缸。一般用於裸缸養大型魚時采用，此種過濾理論上免維護，但仍需要人為手工清理魚缸底部之魚排泄物。
外掛式過濾器扁盒狀，自帶水泵，因體積不大，水流強度也不高，不會大量占用缸中有限的空間，一般用於中小或小型魚缸，維護間格時間較短，維護較方便。
流沙式過濾器比較有爭議的一種缸外過濾器，本身一般無驅動馬達，靠外接水箱中之沉水水泵供水，水流通過桶狀濾艙使其中的專用石英砂粒翻滾以增大附著其上的消化細菌分解水中有害化學物質的能力，屬純生化是過濾器材，理論上完全免維護，但需定期更換石英砂。
過濾設備的選擇一定要根據個人的飼養類別而選擇，一般草缸對生化過濾和物理過濾的要求相對較低，而對及水流的要求相對較高（這裡不是範指的水流大小，而是流速，流量，位置方向的綜合因素）而裸缸和半裸缸，對生化過濾和物理過濾的要求較高，以及過濾設備是否能起到改善水質（分解及濾除水重大量代謝物和提高溶氧量）的作用也很重要！
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