1998年12月，九屆人大常委會將《工會法》的修改工會勞保工作列入立法規劃。1999年初，組成了由全國人大法工委牽頭，全國人大內司委和全國總職業工會工會參加的修改小組，歷時二年零10個多月。2001年10月27日，九屆全國人大常委會關於修改<中華人民共和國工會法>的決定》（以下簡稱《決定》）。《決定》對《工工會健保會法》的修改共有44條，據此修正後重新公布的《工會法》，旨在適應新的形勢，總結實踐經驗，對新建企業工會的組建、企業職工和工會干部合法權益的保護、工會經費的收繳以及對侵犯工會合法權益行為的制裁作出一些補充性的規定，中心是突出和強化工會維護職工合法權益的職能。其修改《工會法》的主要內容如下：

活動准則：現行工會法第四條規定：“工會必須遵守和維護憲法，以憲法為根本的活動准則，依照工會章程獨立自主地開展活動。”這裡規定的工會“以憲法為根本的活動准則”，指的是工會活動要遵循憲法規定的基本原則，以經濟建設為中心，堅持四項基本原則，堅持改革開放，這是工會必須堅持的最重要的根本的活動准則，修正案草案進一步具體規定：“工會必須遵守和維護憲法，以憲法為根本的活動准則，以經濟建設為中心，堅持社會主義道路、堅持人公所健保民民主專政、堅持中國共產黨的領導、堅持馬克思列寧主義毛澤東思想鄧小平理論，堅持改革開放，依照工會章程獨立自主地開展工作。”

職能：為了突出和強調工會維護職工合法權益的職能，新《工會法》規定：“中華全國總工會及其各工會組織代表職工的利益，依法維護職工的合法權益。”“維護職工合法權益是工會的基本職責。工會在維護全國人民總體利益的同時，代表和維護職工的合法權益。”以保障工會組織切實發揮作用，保護、調動廣大職工的積極性。當前一些企業無視職工的勞動條件與安全，隨意延長勞動時間、克扣職工工資、不提供勞動安全保護，甚至限制職工人身自由，嚴重侵犯了職工的合法權益，以致引發惡性安全事故和職工群體性事件，影響社會穩定。對此，工會有責任及時反映情況，並代表職工與企業方面就維護職工勞動權益的問題進行交涉，使企業予以糾正，避免矛盾進一步激化，維護改革發展穩定的大局。因此，新《工會法》規定：“企業、事業單位違反勞動法律、法規有下列侵犯職工勞動權益情形，工會代表職工與企業、事業單位交涉，要求企業、事業單位采取措施予以糾正；企業、事業單位應當予以研究處理，並向工會作出答復；企業、事業單位拒不改正的，工會可以請求當地人民政府依法作出處理：（一）克扣職工工資的；（二）不提供勞動安全衛生條件的；（三）隨意延長勞動時間的；（四）侵犯女職工和未成年工特殊權益的；（五）其他嚴重侵犯職工勞動權益的。”增加這些規定，有利於工會開展維護職工合法權益的工作，增強工會組織的凝聚力，更好地發揮其職能作用。