台灣的副總統吳敦義說，06年台東漁船的漁民被菲槍殺，當時處理不當，種下了今次漁民被殺的禍根。
吳敦義在竹科參加義工論壇時，指摘菲律賓違背國際公義，政府採取制裁行動，是為捍衛國家主權與尊嚴，感謝民眾的支持。
他表示，光看菲律賓政府提出好幾個版本，對道歉閃爍其詞，對賠償也是反反覆覆，似乎已對調查真相、懲罰真兇埋下掩飾的伏筆。
吳敦義指出，案發現場是台菲之間的經濟海域，數十年來未能談好海域的劃分，造成許多不幸事故的發生，例如：2006年1月發生的台東籍滿春億號事件，一名漁民被菲國槍殺，一人受重傷，當時的阿扁政府沒有採取任何捍衛尊嚴的作為，也許讓菲律賓覺得說「台灣好像很好欺負」，所以這次也拖泥帶水、含混應對。
