1、明視場

　　傳統的顯微鏡觀察方法，特別是在醫療和生放大鏡物學領域，用於例如組織切片和塗片一類的染色組織試樣。

　　2、暗視場

　　這種對比方法可在一台照明顯微鏡的有限的分辨率，甚至低於這種分辨率的條件下，觀察細小的結構特性。特別適用於使用反射光的金相和晶體檢驗。需要特殊的聚光鏡，某些情況下需要用油鏡觀察。

　　3、相位對比

　　相位對比方法特別適用於觀察極薄的(小於5μm)，無染色的試樣中的組織或單細胞的，顯微鏡極為細小的組織特點，這種試樣使用其他方法只能獲得非常差的對比度。需要特殊的物鏡和專用的聚光鏡。

　　4、VAREL

　　VAREL是一種使用浮凸方法，顯示試樣結構的對比方法。 由於這種方法對偏振光效應(DIC)不敏感，因而特別適用於放置在塑料容器內的試樣。需要特殊的物鏡和專用的聚光鏡。

　　5、DIC

　　這種Nomarski微分干涉對比(DIC)方法以類似於浮雕的望遠鏡方法，顯示試樣的相差。此方法特別適用於厚的無染色試樣(>5μm)。需要在照明和成像光纖路徑內使用專用的、相對較為昂貴的附件(棱鏡、偏光鏡)。

　　6、偏振觀察

　　偏振對比方法用於識別生物試樣的雙折射結構(晶體)。但是，其主要應用於使用反射和投射光的金相和晶體檢驗。需要天文望遠鏡起偏鏡、檢偏鏡、和補償鏡。

　　7、熒光觀察

　　熒光方法使用熒光色素和特殊的標記技術來觀察微小的組織和細胞結構。這種成像方式(自發光物)組合了最高的檢測敏感度和最高的檢測特異性(生物化金相顯微鏡學標記物)。需要反射光照明裝置(反射鏡)、濾鏡、雙色分光鏡、激勵光源。