二○○四年遭否決的飛彈公投禍延至今。據指出，歐巴馬政府去年一月批准售台最後二套愛國者三型飛彈系統，由於金額超過預算百分之四十，價差達數百億元，致發價書拖延了十九個月，仍無法簽署；美方已通知，若今年底前仍無進度，將重報系統與飛彈價格，屆時價差將更大。

軍方證實確有此事。空軍表示，美方在二○一○年一月同意續售我國二套愛三，總金額確有調增，不過系統及飛彈的單價都比照前四套發價書，並未大幅調升，現正依照作戰需求修訂「投資綱要計畫」，將盡快與美方簽署發價書。

二○○四年一月，民進黨政府宣布在總統選舉同時舉行公投，第一案就是反飛彈公投，結果只有四成五選民領票而不具效力，形同遭到否決。在野的泛藍借力使力，堅決主張三年內不得採購愛三飛彈，導致二○○四年就編好的預算，直到二○○七年底才通過，經費約一千二百億元。

消息人士透露，二○○八年十月布希政府批准售台四套愛三，此時系統與飛彈的報價已比二○○四年編列預算時高出許多，四套價款幾乎與全案經費等量齊觀，後來透過搭配其他國家的愛三訂單才降低分攤研發費，於是在美方宣布出售之後十個月，雙方達成協議簽署發價書，正式產製。

歐巴馬政府去年一月批准出售最後二套愛三，美方同意系統與飛彈報價比照前四套，但報價期限到今年十二月卅一日為止，當時宣布出售的金額約廿八億美元，批准至今超過十九個月仍無下文。

但是，據指出，前四套幾乎把錢用光了，餘款怎麼可能買得起最後二套？軍方幾次與美軍交涉，在壓低價格方面進展有限，總價增漲幅度已大到非修投綱不可，空軍正加快腳步審辦，未來愛三除了增加經費，獲得期程也勢必延長。

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