日本是亞洲東部太平洋地區上一個島國，西面的東海、黃海、朝鮮海峽及日本海將日本與中國、朝鮮、蘇聯等國家相隔，至於東邊則是一望無濟的太平洋。日本由本州、四國、九州、北海道四個大島和三千九百多個小島組成，面積 37.7 萬平方公里。日本國土北起北緯 45 度 33 分，南至北緯 20 度 25 分，東起東經 153 度 59 分，西至東經 122 度 56 分。日本是一個多山的地方，山地面積約佔全國面積的 76%。日本亦是一個位於太平洋地震帶及活躍火山帶上的國家，全國共有二百多座火山，其中三分一更是活火山。日本最高的活火山是富士山，高海拔 3770 多米。

日本境內地震頻繁，但大多數地震級數均不高，不會造成嚴重災難。然而 1923 年 9 月 1 日發生的關東大地震就造成 15 萬人死亡。亦是由於地震及火山兩大特性，形成日本有特別多湖泊及溫泉。

日本大部份地方的氣候均屬海洋性氣候，只有南部、四國和九州乃亞熱帶氣候，而北海道一帶則是寒溫帶。日本的夏季常受颱風威脅，冬季就會受西伯利亞的寒風吹襲，天氣寒冷，本州等地更是經常下大雪。