MATRIX的世界
錫安（Zion）
在電影中錫安被稱作真實的世界，它處在靠近的地心的地方。在那裡是地球上僅存的溫暖的地方。錫安裡的人民艱難的生活著，他們不斷地和機器人作戰以求幸存下來。他們穿著質地很差很薄的衣服，他們吃營養粥（這個東西沒有任何味道，僅僅有維持生命所需能量），他們面臨著朝不保夕的生活。但是錫安裡有很多人試圖改變這一切，他們尋找各種方法，試圖結束機器人對他們的攻擊。
01（機器城）
這裡是機器人的世界，它處在地表。到處都是管道和機械廢墟，還有一望無際的養殖場。由於人類戰敗給了機器人，而機器人又沒有太陽能作為持久能源，所以人類被機器人圈養起來作為它們的電池。人類被用來作為電池，是因為人體本身會產生120伏電壓和超過25000熱量單位的生物電能，而且具有持久性和再生性等優點，機器人把死去的人溶化為液體，然後用這些液體來喂養生長在容器中活著的人。
機器人把戰爭中幸存的人類都放置在特殊的容器中，在人身上加入很多插頭以提取電能。但是，人是有思想的，人只要活著思想就會存在。所以在人的腦後還有一個插頭，機器人利用這個插頭，讓人類的思想進入它們編造出了虛擬的世界 -- Matrix，這樣人類就意識不到自己被圈養在容器中，而是以為自己還是活在1999年。
但是，世間萬物都不是完美的，程序也是如此，在Matrix這樣一個精神世界中生活的人們中，總有人會發現程序造成的錯誤。於是，就有特工去消滅那些試圖打破Matrix規則的人，並且消除錯誤。而錫安中的人，他們就努力去拯救那些特工所要消滅的人。因為不相信Matrix的人就是錫安所需要的人。
戰後的世界
說到這裡，就不得不談到機器人和人之間得戰爭的後果。為了挽回敗局，人類決定遮蔽整個天空，因為機器人是靠太陽能供電，沒有了太陽光機器人也就沒有了能源。人類徹底破壞了天空，整個地球籠罩在無邊的黑暗之中，從此，地表不在有植物、不再有生物，地球表面都處都是寒冷的世界。人類在這種情況下想活下來就需要熱度，而且人類也需要能量來進行各種生產，所以人類居住在靠近地心的地方，那裡不僅溫暖而且有地熱資源可以提供。在地球表面統治著地球的已經不再是人類，不再是任何細胞構成的有血有肉的生物，而是機器人！
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