過關是指回到坐標(0,0)打開機關

第0關: 拾起坐標器即可過關

第1關: 向右移動1次,根據地圖,移動到有標記的位置
轉動全部機關即可過關
(即是(1,1) (1,-1) (-1,0) (0,1) (-1,1) (0,-1) )

第2關:
向右移動1次,向上移動1次,打開機關,會得到一個十位數
十位的數字代表X軸,個位數字代表y軸
(例如數字是43,即代表(4,3) )
依此去到相應坐標按下機關,重複以上動作直到左上角的綠燈全開
即可過關

第3關:
首先去到(1,1) ,可以看到四個數字,有六個按鈕,分別是控制其中三個數字的升降
其中會有一個數字是不能改變,記下
分別去到(-1,1) (-1,-1) (1,-1),重複以上步驟找出所有不變的數字
會找出以4個不變的數字,將4個不變的數字輸入在機器上
然後去到(0,1)及(0,-1)轉動機關,過關

第4關:
觀察地圖,記住所有的標記的位置
分別順序轉動從一個○ 至 六個○的機關
過關

第5關:
觀察地圖,記住所有的標記的位置
去到標記的位置,會見到二個英文字
將目前的坐標轉成英文字,然後輸入,過關
(1=A,2=B,3=C......)
(例如坐標是(1,2),那英文字改成(A,B) )

第6關:
觀察地圖,記住(-1,0)以外標記的位置
去到相應位置,可能得到一個圖形及一個數字
數字代表圖形應該放置的位置
(例如是3,那個圖形就應該放在由左至右的第3個位置)
將所有圖形及數字記住
到(-1,0)輸入在機器,再按左下角的按鈕,過關

第7關:
PS.本關地圖被破壞
先到(0,-1)拉動機關,然後到(0,1)觀察圖像,
記住線的方向(\/ \/ /\)
然後依序去到(1,-1)至(6,-1)
將機關結合,會有二個綠燈,用線連起來只有(\)和(/)這二個結果
根據(\/ \/ /\)去將所有機關正確結合
完成後到(1,1)拉機關,過關!

第8關
觀察地圖,記住(0,-1)以外標記的位置的坐標
將坐標輸入(0,-1)的機器,然後到相應坐標拉機關
重複以上步驟即可過關

第9關:
PS.本關沒有地圖
先到(0,1),記住不能改變英文字的位置及相應的英文字
然後到(0,-1),記住不能改變色彩的位置及相應的色彩
(英文字代表色彩,例如R=Red,G=Green等)
將(0,1)記下的東西轉換成色彩輸入(0,-1)
將(0,-1)記下的東西轉換成英文字輸入(0,1)
完成後按下(0,-1)的按鈕,過關

第10關:
將(-1,0)的地圖改成跟(1,0)的地圖一樣
完成後轉動(0,-1)的機關,過關!

第11關:
PS.本話為最終話,有Good End和Dead End
先觀察牆上字條,翻譯如下:

讀我！
你有沒有注意到隨著每個難題的破解你都往更深的地底下移動呢？
這看來並不是一個好的逃脫計畫。無窮迴圈本身是一個大陷阱，
為了逃離它你必須停止破解難題，不然會永遠困在迴圈裡。
這迴圈是永久、無限、沒有開始和結束的，
這真是你自己在離開燈塔後所能找到最壞的地方了。這是我要你做的：
不要打開在(0,0)房間的傳送器，而是要去找一片樹葉並把它帶到(-12,9)房間裡的機器那裡。
這應該可以讓你從迴圈中脫離，依情況你將會到達實驗室，或其他接近的地點。祝你好運！

Dead End:
無視紙條,繼續解迷
到(0,1)和(0,-1),記下不同的色彩分別代表不同的數字
(例如BPY=305,即B=3,P=0,Y=5)
到(1,1)及(-1,1) 將所有色彩下降,然後按照相應數字將所有色彩上升
(例如B=3,先將藍色全部下降,再將藍色上升3次)
完成後轉動(-1,-1)及(-1,1)的機關,過關
然後就會出現以下文字:

最後你只能等著脫水而死了

Good End:
聽從紙條的指示,在以(0,0)為中心四周的9格之中找一片樹葉
帶它到(-12,9)房間裡的機器上
然後就會出現以下文字:

你認為你能逃出去
你認為你破解了所有的難題
但事實上
你並不想
從這Submachine中逃出
等在實驗室再會吧